Hasegawa Kouta é um estudante do segundo ano do ensino médio completamente mediano. Ele sente como se algo estivesse faltando em sua vida e que é impossível para alguém como ele ter uma vida escolar brilhante. Então, um dia, enquanto está com os amigos, Kouta encontra uma garotinha desaparecida e ela lhe dá um adesivo de Pompompurin por ajudá-la a encontrar a mãe. Isso lembra Kouta de como ele costumava amar Pompompurin quando criança, especialmente por causa do enorme Pompompurin de pelúcia que sua amada avó lhe deu de presente de aniversário, mas foi forçado a deixar isso de lado por pressão dos colegas. No entanto, na escola ele pega um chaveiro perdido de My Melody e percebe que pode pertencer ao muito chamativo e popular Mizuno Ryu, como isso é possível?